耐药是影响核苷(酸)类药物抗乙肝病毒治疗疗效的重要障碍。当用核苷(酸)类药物长期治疗时，耐药的发生较为常见。耐药不仅可使已取得的治疗效果(如组织学改善等)丧失，还可导致肝脏病变急剧恶化，使疾病进展(如肝炎复燃、肝脏失代偿、肝衰竭 等)。已有多项研究显示，耐药患者的肝硬化和肝癌发生率明显高于非耐药患者。交叉耐药、多药耐药等将增加后续治疗的难度，限制再治疗的选择。