尽管体外冲击波碎石术是一项安全、有效的微创治疗方法，但冲击波在击碎结石的过程中由于结石的震动与碎裂对肾盂黏膜和结石周围的肾组织也会产生轻微的损伤。经过大量的临床观察，发现冲击波碎石的主要并发症有：

　　血尿:体外冲击波治疗后，几乎所有的病人都会出现轻重不同的血尿，尤其是肾结石患者更为常见。碎石后病人出现镜下血尿或轻度肉眼血尿一般不需要特殊治疗，只要多饮水2000ml以上，1~2天即可自然消失。血尿严重的病人应及时到医院找专科医生咨询或处理。

　　膀胱刺激症：较大结石多含有细菌，当结石被粉碎后细菌突然在尿液中的浓度增加而引起感染;同时，由于结石沙粒在输尿管狭窄部位的堆积、阻塞，尿液排出不畅，给细菌提供了滋生的环境，是引发尿频尿急尿痛的重要原因。因此，要求在应在碎石术后给予抗生素治疗，预防和控制术后感染。

　　肾绞痛：碎石后发生肾、输尿管绞痛较为常见，这是由于对体积较大、质地坚硬的结石，一次很难将其全部碎成沙粒，当有较大的结石碎块堵塞输尿管时就会产生绞痛症状。一般不需要特别处理，给予解痉、镇痛药物对症治疗后，多数病人症状能够缓解。