临床对瞳孔的检查非常重视，无论在眼科、内科、神经科、脑外科等都有重要的临床意义。医生可根据瞳孔的大小和对光线的反应，来判断疾病的部位、性质，对疾病的诊断和预后都有很大帮助。
　　体格检查：
　　1、一般检查注意体温。发热时多为一些感染性疾病如海绵窦血栓、脑炎、脑膜炎;眼球突出可见于海绵窦血栓、眶内肿瘤、颈动脉海绵窦瘘;眼部有杂音见劲动脉海绵窦瘘;眼、颈部或脑部外伤;颈部和咽部有无肿瘤、炎症、肿大淋巴结等。
　　2、瞳孔是扩大或缩小，是一侧还是双侧。直接和间接对光反射，眼裂大小，眼球有无突出、充血，眼球活动功能是否受到影响，视力与视野如何，有无复视，眼球运动异常和辐辏异常等，同侧面部运动、感觉和出汗情况，眼底有无视乳头水肿、充血和萎缩。其他神经系统定位体征如肢体瘫痪、感觉异常、植物神经功能异常等。
　　辅助检查：
　　1、脑或眼部CT或MRI：检查有无脑部肿瘤、炎症、血栓、血管畸形、脑干病变、延髓空洞症及眶部肿瘤、炎症等。
　　2、脊髓MRI：检查有无脊髓空洞症，肿瘤，炎症等。
　　3、甲状腺检查、血糖检查、颈部、肺部和咽部的X线检查和组织病理学检查等。