对于长期服用质子泵抑制剂，而又无法停药的的患者应注意其对营养物质吸收的影响：
　　对钙吸收的影响： PPI的强力抑酸作用破坏了胃和十二指肠上段的酸性环境，使钙不能离子化而留存在食糜中，影响其吸收。钙长期吸收不足将引起血钙浓度降低，刺激甲状旁腺素释放，继而促进破骨细胞所介导的骨质吸收，导致骨质疏松，从而增加骨折的发生率。
　　对非血红素铁吸收的影响：因为PPI强有力的 抑制胃酸分泌，使三价铁不容易还原为可吸收的二价铁，后者才能更多地与活性维生素C、糖类、胺类形成复合物，有利于其在十二指肠的吸收。
　　对维生素B12吸收的影响：PI抑制胃酸分泌，减少食物中的素B12与食物蛋白分离，游离出来后与R蛋白及内因子结合，到达回肠末端被吸收。