各类腹腔镜手术，尤其腹腔镜胆结石、胆管切开取石结石、胰管切开取石，腹腔镜巨脾切除治疗肝硬化门脉高压症手术、腹腔镜胰十二指肠切除术治疗胰头癌、壶腹部肿瘤，腹腔胰腺中段切除、胰体尾切除治疗胰体尾肿瘤，腹腔镜肝切除治疗肝血管瘤，肝肿瘤，腹腔镜胃癌根治术等等。达芬奇外科机器人手术；机器人肝癌切除术，机器人胰十二指肠切除术。浙江省首位取得达芬奇外科手术主刀资格证书。各类复杂开腹手术：肝胆管结石多次手术、巨大肝癌、胆管癌、胰腺癌、胆囊癌、等外科手术胰腺癌的规范化治疗：按全球胰腺癌治疗效果最好的美国s翰霍普金斯医院的治疗规范。肝癌的综合系统化治疗：手术、射频、插管化疗、生物靶向治疗等

1994年8月至2012年3月在浙江大学附属邵逸夫普外科工作，2012年4月至今在浙江省人民医院工作。2013年受邀访问美国s翰。霍普金斯医院、科罗拉多大学附属医院以及UCLA，并和国际著名胰腺外科专家John L. Cameron进行了深入交流。2014年访问了日本东京帝国大学、大阪大学附属医院。现任浙江省人民医院肝胆胰外科主任、微创外科主任、美国外科学院院士、国际肝胆胰协会委员、亚太肝胆胰协会委员、中华医学会肿瘤学分会胰腺癌分会委员、中国抗癌协会胆道肿瘤学组委员、中国医师协会外科医师分会机器人外科医师委员会委员、中国医师协会外科医师分会肿瘤学分会委员、卫生部内镜与微创外科全国医师定期考核专家委员会常务委员、卫生部医疗事故鉴定专家。洪德飞教授一直致力于肝胆胰外科临床与基础研究，除了在肝门胆管癌、肝尾叶切除术、二步肝切除术治疗巨大肝癌有一定造诣外，在胰腺外科领域也做了一定的创新工作，和恩师彭淑牖教授共同提出了“胰门”的概念、创建了“捆绑式胰胃吻合术”和“半捆绑式胰管对空肠粘膜吻合术”，并在国际上首次将“捆绑式胰胃吻合术”和“半捆绑式胰管对空肠粘膜吻合术”应用于腹腔镜胰消化道重建术，获得了同行的认可和广泛应用，并提出了根据胰管直径、胰管解剖位置、胆肠吻合口瘘的风险个体化选择胰消化道重建术的策略和技术，可有效降低胰瘘和胆肠吻合口瘘的发生和潜在危害；针对胰消化液直接接触的胰肠/胰胃吻合术，在国际上首次应用生物膜封闭胰腺切面技术可有效避免因胰腺切面被腐蚀而引起消化道大出血的致命并发症，并获得了胰消化液接触性吻合胰腺切面保护安全套的发明专利。洪德飞教授也是我国较早开展腹腔镜胰十二指肠切除术治疗胰头癌、壶腹部周期肿瘤、腹腔镜胰腺中段切除术、腹腔镜胰体尾切除术治疗胰体尾肿瘤、腹腔镜巨脾切除联合贲门周围血管离断术治疗肝硬化门静脉高压症。也是我国较早将应用血管交叉提拉技术和胰腺全系膜切除技术于胰头癌根治术的专家之一，有利于提高胰头癌的根治性和彻底性。洪德飞教授也是我国较早开展达芬奇机器人肝癌切除术，达芬奇外科机器人胰十二指肠切除术等国际先进水平手术的专家之一。洪德飞教授已在国内外发表SCI及中华系列杂志论文（通讯作者和第一作者）71篇。主编专著2部。2008年人民卫生出版社出版《腹腔镜肝胆胰脾外科手术操作与技巧》，2014年人民卫生出版社出版《胰十二指肠切除术》。