擅长应用胸腔镜微创技术开展手术治疗胸外科疾病。国际首次应用肺组织瓣代气管代食管治疗气管肿瘤、气管狭窄及晚期食管疾病，开展了超长段气管切除、肺组织瓣气管重建以及食管肿瘤切除食道重建等疑难重症手术。

石文君，男，教授、博士生导师、胸外科主任、中国医师协会沈阳市胸外协会主任委员、中华医学会辽宁省胸外学会副主任委员、国际抗癌联盟委员、中国教育部科技进步奖评委。从医40余年，对胸外科常见病、多发病、疑难重症的诊断与治疗具有丰富的经验，且对胸腔镜技术(VATS)造诣颇深；在世界上首次应用肺组织瓣代气管代食管，现已成功救治多位垂危的气管肿瘤、气管狭窄及晚期食管疾病患者，目前该项技术的研究达到国际先进水平；在国内率先开展超长段气管切除、肺组织瓣气管重建，食管肿瘤切除重建，气管肿瘤切除、气管重建；其两次获得省政府科技进步奖，每年亲自领台手术达600多例，并肩负全省各大医院胸外科病人会诊、查房及手术等任务，手术例数及疗效均处于国内领先水平。