一、检查的疾病不同
　　乳腺钼靶检查：
　　（1）检查出多种乳腺疾病。诸如乳腺增生、乳腺纤维瘤、乳腺囊肿、临床不能触及的肿块病变、乳头溢液等。
　　（2）检查出早期原位乳腺癌。尤其是对于直径小于1cm的原位钙化乳腺癌，彩超不能精确诊断，钼靶却可以。
　　乳腺彩超检查：
　　（1）判断乳腺肿块的性质。乳腺彩超检查是当女性出现乳腺肿块的时候，根据彩超显示的图像来鉴别肿物的性质，判断是囊性还是实性肿物。
　　（2）帮助排查乳腺肿瘤。彩超还可以显示乳腺内部的细微结构。对于乳腺钼靶检查无法检测的致密乳腺，可以帮助排出肿瘤；而且，对于腋窝及锁骨上淋巴结转移，超声可以提示有无淋巴结增大。
　　在此，需要提醒的是：乳腺钼靶检查与乳腺彩超的诊断准确率都比较高，很多人之所以会认为乳腺钼靶检查准确率高，主要就是因为乳腺钼靶检查可以检查出钙化的乳腺癌，彩超却不能。
　　这实际上是患者的认识误区，乳腺钼靶检查对于那些没有表现出钙化现象的早期乳腺癌，必须借助于乳腺彩超才能精确诊断。因此，二者各有所长，必要时需要联合使用。
　　二、适合人群不同
　　乳腺钼靶检查特别适合对软组织的透照成像检查，而年纪在35岁以下的女性，由于乳房腺体比较致密、纤维组织丰富，常表现为整个乳房呈致密性阴影，缺乏层次对比。所以35岁以下女性进行钼靶X线的价值远不如35岁以上女性意义大。
　　乳腺彩超检查则比较适合年轻女性，适合作为乳腺疾病的普查方法。
　　三、检查原理不同
　　乳腺钼靶检查是目前诊断乳腺疾病的首选和最简便、最可靠的无创性检测手段，安全无痛苦，简便易行，且分辨率高，留取的图像可供前后对比。不过，具有放射性，不宜短期内反复进行。
　　乳腺彩超检查也就是乳腺彩色多普勒超声，是通过多普勒原因区分不同的乳腺组织的回声。此项检查没有放射性，可以定期反复使用。