绝大多数的甲状腺囊肿可以保守治疗，不需要手术。

　　对于囊肿的处理首先是穿刺抽吸囊液，囊液吸尽后对囊肿的实质部分进行细针穿刺确定性质。结果为良性的仅随访或试用甲状腺素抑制治疗，如果囊液中或实质部分穿出物中发现癌细胞或可疑癌细胞的必须手术治疗。

　　由于甲状腺囊肿大多数情况下是良性的，在穿刺排除恶性病变的基础上，囊肿不必手术，可以保守治疗，包括进行单纯细针穿刺抽吸治疗，部分人的囊肿经过一次穿刺就治愈了，另外一些人囊肿抽吸后还会复发，可在2～4周后再次穿刺，经过2～3次抽吸后仍复发的可以囊内注射硬化剂治疗。硬化剂治疗的方法就是吸尽囊液后向囊腔内注入硬化剂，吸出的囊液行常规病理检查，必要时行甲状旁腺素(PTH)检测以除外甲状腺旁腺囊肿。