功能神经外科的定义：采用手术的方法修正神经系统功能异常的医学分支是为功能神经外科学（Functional Neurosurgery），早期亦称生理神经外科学（Physiologic Neurosurgery），或应用神经生理学（Applied Neurophysiology）。手术针对特定的神经根、神经通路或神经元群，旨在有意识地改变其病理过程，重建神经组织的正常功能。
　　功能神经外科的治疗范畴：
　　①运动障碍病（movement disorders）：曾被称为锥体外系疾病（extrapyramidal diseases），是基底节区病变导致的以运动功能紊乱为主要临床特征的疾病群。帕金森病是其中的典型代表，此外还包括原发性震颤、肌张力障碍、舞蹈症和抽动秽语综合征等。从影响运动功能的角度，脑瘫也可归为此类；
　　②癫痫病（epilepsy）:发作是癫痫病的主要临床特征，发作时的表现广泛影响精神、运动、感觉和植物神经，发作间期可完全正常。依致痫灶解剖位置的不同可分为颞叶癫痫、额叶癫痫、顶枕叶癫痫和一些癫痫综合征等；
　　③疼痛（pain）:常常是疾病的一种症状，有些亦可单独称病。外科手术治疗的是那些慢性的顽固性疼痛。典型的如带状疱疹神经痛、幻肢痛、截肢痛、丘脑痛、盆腔痛、腹腔痛、胸腔痛、腰背痛以及三叉神经痛、舌咽神经痛等。面肌痉挛是个例外，除少数伴随三叉神经痛的面肌痉挛患者外，不应该包括在疼痛的范畴之内，但由于与三叉神经的治疗一样，微血管减压手术有效，故常常放在一起讨论；
　　④精神紊乱（mental disorders）:手术方法治疗精神疾患的历史可以追溯上百年，很多的努力放在了精神分裂症的治疗上。氯丙嗪的出现使人们放弃了这种高致残率的手术，近些年来，尽管手术技术的进步使严重并发症的威胁越来越小，但资料显示精神分裂症的手术疗效极其有限，比较肯定的手术适应症是焦虑症、强迫症和抑郁症。