脑干包括（间脑下端、中脑、桥脑和延髓），活检具有危险性，术后反应较重。延髓病灶一般不主张活检，脑干病变和肿瘤最好发的部位是桥脑和桥小脑臂，所以也最常见。脑干肿瘤中90％为神经胶质瘤，而半数以上为星形细胞瘤，肿瘤多位于桥脑，其次为延髓，位于中脑者罕见。脑干部位的星形细胞瘤CT上可见脑干的增粗，左右不对称及出现低密度或混杂密度的肿瘤病灶影。但CT显示脑干胶质瘤不如MRI理想。
　　方法：①桥脑以上病变活检一般取半坐位，采用经额后及侧脑室自上而下路经活检，在矢状位上活检轨迹应与脑干平行，穿刺径路沿脑干纵轴，冠状面上沿小脑幕缘内侧进入，活检针应避免通过脚间池和环池。插图②对于小脑中脚平面以下桥脑和桥臂的病灶，患者可以可取俯卧或侧卧位，采用经后颅窝经小脑一侧入路。插图 ③脑干病变体积较小，活检标本采集不能很多，可应用细针吸引的方法采取标本。
　　Amadani总结13个活检中心资料，脑干病变立体定向活检阳性率为96％，有半数病例活检诊断是神经胶质瘤、转移癌，另一半是血肿、血管畸形、淋巴瘤、脱髓鞘病变、囊肿、放射性坏死、脓肿、血管炎、梗死、白血病、隐球菌感染或肉芽肿等。Goncalves-Ferreira等报道了30例怀疑脑干胶质瘤的立体定向活检，也仅一半证实为星形细胞瘤，且大多数(8／14)是小结节性非浸润性肿瘤。