妊娠期亚临床甲减对胎儿神经智力发育的影响尚不明确。一项大规模的病例对照研究结果表明，与甲状腺功能正常的孕妇相比，未经治疗的亚临床甲减孕妇的后代智商评分降低7分，7岁到9岁的儿童运动、语言和注意力发育迟缓。中国医科大学课题组的一项回顾性研究获得了相同的结论，筛查来自1268例16-20周孕妇的血清，获得单纯亚临床甲减（FT4、TPOAb正常）18例、正常孕妇140例，对她们后代在出生后25-30个月时进行随访，MDI和PDI较正常对照组分别减低9.98和9.23分差异有统计学意义。薛海波等分析妊娠妇女TSH升高的程度与儿童智力发育的关系发现：TSH>=3.93mIU/L孕妇后代的MDI和PDI显着降低而2.5mIU/L<TSH<3.93mIU/L孕妇后代的上述评分与正常对照组没有显着差别特异参考范围的上限（3.93mIU/L），而不应当是2.5mIU/L。最近发表的CATS研究结果显示,对390例亚临床甲减或者低T4血症妊娠妇女，在平均12周3天时启动L-T4(150ug/d）干预，测定她们出生后代3岁时的智商，与未干预组（n=404）比较没有显着差别。阴性结果可能与2个原因有关：（1）妊娠12周启动干预时间过晚；（2）孕妇亚临床甲减程度较轻，TSH中位数平均3.8mIU/L（对照组为3.2mIU/L）。