PET--CT仪器、安装以及所需的放射性药物是非常昂贵的，机器的养护价格也不菲，导致PET--CT检查费居高不下，但是，PET--CT检查费虽然昂贵，如果全面对PET的诊检费用/效益进行分析，受检者得到的益处往往远大于为检查付出的费用。因为通过PET检查可以对病人进行更加准确的诊断，使病人直接得到及时有效的治疗或避免了许多不恰当的检查和治疗，在总体上大大减少了病人的医疗费用，因此在美国等发达国家PET--CT的多项检查已经被列入医保范畴；如肺癌的病人，由于PET--CT是全身扫描，可以观察到全身其他部位有无转移性病变，若发现转移，治疗就由手术改为化疗等保守性治疗，节省了医疗费用，更重要的是避免了不必要的手术，减少病人的痛苦，有利于提高病人的生活质量。