如果进行充分的药物治疗后，角膜炎仍然得不到控制，在细菌毒素和机体免疫等因素的复杂作用下，角膜基质组织不断坏死脱落，溃疡继续向深部发展，进一步则会发生角膜溃疡部位的穿孔。如果不进行治疗性的角膜移植手术，炎症会迅速向眼内扩展，最后导致全眼球炎而丧失眼球。如果在病变尚未侵及全层角膜时选择板层角膜移植术，则可切除病变组织，还可减少术后免疫排斥反应。如果此时病变已累及全层角膜，则行穿透性角膜移植手术，彻底切除病变组织，控制炎症，以免发生角膜穿孔，而挽救眼球。

　　但是，由于此时的角膜移植手术是在眼球处于一种极度充血的炎症状态下进行的，所以术后炎症有复发的可能;并且，炎症充血会增大角膜移植手术的免疫排斥反应发生的几率。故术后应严格遵照医嘱用药，及时复诊。