容易自动排出的结石：
　　新诊断的尿路结石，直径如果小于0.4厘米，90％会自行排出。建议的治疗方法是保守疗法与密切观察，多饮水、多运动。如果症状持续或反复发生（肾绞痛、发热、感染、肾积水等），则建议采取积极的治疗方式。对于尿酸结石还可以考虑用药物溶石疗法。遗憾的是泌尿系统大部分结石，都不是尿酸结石。故溶石方法并不常用。
　　不容易自动排出的结石：
　　目前对于不容易自动排出的结石，已很少采用开放性手术治疗（开刀）。碎石的方法有：冲击波、气压弹道、超声波、激光等。
　　体外冲击波碎石，是利用体外冲击波聚焦后击碎体内的结石，使之随尿液排出体外。优点是不需麻醉、不用手术。缺点是对于体积较大，较复杂的结石效果不佳，多次治疗后会对肾脏有损害。
　　由于体外冲击波击碎结石的同时对肾组织也会产生损害，所以两次治疗时间间隔应大于一周。小于三次体外冲击波治疗对肾组织损害一般可以完全修复，治疗的次数越多对肾组织的损伤越大。因此总治疗次数最好掌握在三次以下。体外冲击波碎石适合于直径小于2厘米的结石，而且没有尿路梗阻性病变的肾结石患者。
　　由于胱氨酸结石的物理性质，冲击波不能将其击碎，因此体外冲击波碎石不适合胱氨酸结石的治疗。其它种类的结石患者均可接受体外冲击波治疗。
　　总之，体外冲击波碎石术对肾结石的治疗是有选择的，不是适合所有的病人。有一些医疗机构为了追求经济利益，无选择的对体积较大的肾结石多次反复治疗，不仅没有治愈肾结石，反而造成了严重的肾功能损害。
　　对于直径大于2厘米的各种肾结石（包括各种肾盏结石和肾盂结石）和肾鹿角型结石，不适合用体外冲击波碎石治疗，而应采用经皮肾镜手术。
　　对这样的结石，传统的治疗方法是开放性手术（开刀），现代科技几乎使这一传统技艺失去生命力。经皮肾镜手术损伤小（微创）、出血少、恢复快。结合超声与气压弹道碎石，可以将碎石、清石一次完成。
　　输尿管结石症状重，但处理起来比肾结石容易，方法也更多。根据结石的大小、部位、梗阻时间和性状可以采用：等待观察、体外冲击波、输尿管镜等方法。
　　即使是大的膀胱结石，目前通过非开放手术的方法，也能将其打碎取出。
　　所以即使罹患了泌尿系统结石，也不必恐慌。不能自己排出的结石，大多通过微创治疗也能解决。
　　若想减小患结石病的机会，多饮水、多运动是关键。