人类利用针灸治疗动物疾病已有悠久的历史，早期的针灸主要用来治疗马的疾病，也常用来治疗农场动物和伴侣动物。较早记录兽医针灸的书出现在西晋（公元265～315年）葛洪的《肘后备急方》中，他利用针灸刺络术来治疗马病。
　　动物的身体上也有经络穴位。现代兽医针灸学包含使用针刺、艾灸、穴道注射、低量镭射、磁石和其他多种技术测试或刺激动物身体上的穴位，进而诊断和治疗动物的多种疾病。在临床上，针灸成功地应用于动物肌肉骨骼性疾病、神经性疾病、皮肤性疾病、心血管疾病、生殖系统疾病及镇痛。
　　在新加坡，动物园的兽医们用“针灸中药联合疗法”帮助大约200头动物战胜了病魔，其中包括长颈鹿、大象、马、蟒蛇和海狮。动物园高级兽医师表示，虽然西药仍然是动物园兽医院的“主力治病手段”，但当西药不能帮助动物们解除病患时，中药和针灸成为了重要的替代疗法。兽医们为“动物病号”扎针，帮助动物们减轻了包括骨折后肿胀在内的多种痛苦。虽然，给大象扎针灸要困难一些：只有用那些巨大的不锈钢工业用针（大约20厘米左右长，直径0.6厘米以上）才能穿透大象们那2.5厘米厚的皮肤和10多厘米厚的肌肉，但是，为了帮助它们早日恢复健康，兽医们都乐此不疲。
　　日本更是将针灸运用到了美食中。为做出世界上最美味的寿司，日本人给金枪鱼做针灸。日本大阪的一家公司在日本国际海产品展示会上展示了给金枪鱼做针灸的技术，并已申请了专利。该公司称针灸能让金枪鱼平静下来，使其血液更纯净, 肉质更鲜美。而且，接受针灸的金枪鱼无需喂食药物，经过运输后肉质也能保持新鲜。该公司表示下一步将会给大马哈鱼做针灸测试。
　　虽然，针灸治疗动物疾病有着神奇的功效，但在诊断疾病之前就用针灸是不可取的。因为针灸后可能掩盖一些症状，从而给诊断造成困难，延误病情。急性病、生命垂危的动物不能运用针灸治疗。另外妊娠动物、心脏病及心律失常的动物也不适合用针灸疗法。