在动物实验中,干扰素α具有明显的生殖毒性。虽然目前尚无干扰素α用于妊娠妇女的资料,但其对人类致畸的可能性不能排除。干扰素对于造血、神经等系统都有不同程度的不良反应，因此绝不能用于治疗乙肝孕妇，妊娠是干扰素治疗的绝对禁忌证。最新的亚太地区乙肝防治指南指出：干扰素不能用于妊娠乙肝妇女；如果妊娠乙肝妇女需要治疗，也只能选用人妊娠B类药物。