干扰素是最早的抗病毒药物，他在丙型肝炎中的主导地位目前没有任何药物能够撼动，干扰素联合利巴韦林是国际通用的抗HCV方案，特别是聚乙二醇干扰素联合利巴韦林，对于难治性丙型肝炎，一些蛋白酶抑制剂等将要相继上市，但大多也要和干扰素联合。

　　关于干扰素抗乙型肝炎虽然近年来受到核苷类似物挑战，但仍有其不可替代的作用，首先他的作用是多方面的，包括调节免疫作用、直接抗病毒作用、抗纤维化作用，还有的专家认为可以一定程度的减少肝癌的发生。其次他对HBeAg/抗KBe的血清转换率、HBsAg的消失率是核苷类似物无法比拟的，对于年轻人、没有应用干扰素禁忌的应该首先使用干扰素治疗，如果没有效果或本身由于年龄、副作用、工作、生活等因素不能应用干扰素可以考虑核苷类似物，干扰素最大的缺点是HBVDNA转阴率、转阴的速度明显不如核苷类似物，并且在应用期间副作用明显，要加强检测。