针灸疗法在临床上主要用于治疗疾病、协助诊断、针刺麻醉和预防保健四个方面。
　　一、治疗疾病：针灸疗法已被广泛地应用于临床各科常见病的治疗。从临床报道看，针灸可以调动人体各方面的积极因素，抑制病变过程，消除致病原因，从而起到肯定的治疗作用。其中对于各种功能性疾病、疼痛性疾病，和感觉、运动障碍等神经性疾病能起到显著的疗效而成为主要的治疗手段。但是，应该看到，针灸对多数明显的器质性改变换无法治疗其根本原因，对多数疑难重症只能起到辅助治疗作用。
　　二、协助诊断：针灸协助诊断疾病主要体现在两个方面：1、通过检查腧穴或某些特定部位，来推测疾病的性质、部位以及属于何经和虚实状态等，如通过耳穴部位诊断内脏疾病。2、针刺有助于有关理化诊断的顺利进行并提高其诊断阳性率，如在上消化道 X 线透视、钡餐造影、纤维胃镜、食道镜等检查中的应用。有着较好的效果。
　　三、针刺麻醉：针刺麻醉具有四个方面的优点：1、使用安全，无麻醉药物过敏和其他毒副作用。2、病人处于清醒状态，能够与医生配合，提高手术效果。3、具有调整功能，术中生理扰乱较少。4、术后疼痛轻伤口愈合快，有利于病人康复。在前颅窝手术、甲状腺切除术、颈椎前路手术、肺叶切除术、子宫全切除术、剖腹产和输卵管结扎术等手术中，应用针刺麻醉有较理想的效果，从而成为目前较为理想的麻醉方式。
　　四、预防保健：现代研究已经证明，针灸对人体细胞免疫功能及体液免疫功能都有良好的双向调节作用，同时对人体各系统的功能活动也都有调节作用。这为古人将针灸用于预防保健提供了科学依据。从目前临床看，如冬病夏治（伏天灸肺俞、风门等穴）防治哮喘，以及常灸足三里、关元、气海等穴强壮身体、延年益寿，都有较好效果。