穴肛病人由于其膀胱颈、尿道、阴道皆有缺失，且脊椎神经、骶骨、脊髓发育情况较差，因此手术极为复杂。通过手术要解决4个问题：一是膀胱颈和尿道的成形，使得患者可以控制排尿；二是阴道的成形，使得患者成人后能从外形到生理成为一个正常女性；三是由于患者的输尿管和膀胱对接异常，要对其重新进行吻合，四。是要成形肛门，使其能正常排便。