在我们的肠道生长着巨大的生物群落，它们就是与我们的生命息息相关的肠道微生物。

　　肠道微生物包括我们常说的肠道菌群，以及病毒和真核生物等。肠道菌群目前认为大约有2000多种，数量有1014，比人体的细胞数还多，主要包括厚壁菌门（the Firmicutes）、拟杆菌 （Bacteroidetes）、放线菌（Actinobacteria） 、变形菌（Proteobacteria）四大类。人类微生物菌落工程（the Human Microbiome Project）研究表明每个个体的肠道菌群不同，像指纹一样具有自己的专一性，双胞胎的微生物群近50％的相似性，说明宿主的基因型在肠道菌群的构成中发挥主要作用，人体菌群一旦建立就相对稳定，而饮食、药物是改变其构成的主要因素。研究显示进食一天高脂、高糖、高蛋白饮食就可明显改变肠道菌群。以高脂饮食为主人群，肠道拟杆菌占优势，而高碳水化合物饮食者，肠道变形菌占优势。抗生素对肠道菌群的影响至关重要，有些甚至可以说是毁灭性的，抗生素应用后有些菌落数月难以恢复，某些种类可以长期减少，甚至消失。

　　那么，人体的肠道菌群是如何建立的？以往我们认为胎儿是无菌的，但是目前发现胎儿体内存在少量细菌。分娩过程是人体接触细菌的首要途径，自然分娩的婴儿其体内的菌群与母亲阴道菌群相类似，剖腹产的婴儿的菌群则主要是皮肤菌群如葡萄球菌属和丙酸菌属，此种影响会持续一年。幼儿在初期的肠道菌群主要是需氧菌，随着辅食及固体食物的添加逐渐被厌氧菌取代，幼儿在2.5岁时肠道菌群分布接近成人水平。

　　肠道菌群对人体有什么影响？肠道微生物与哺乳动物共同进化数百万年，哺乳动物免疫系统的发育成熟需要肠道微生物，无菌状态下的动物表现为sIgA减少，胃肠道相关淋巴组织、Peyer’s小体、肠系膜淋巴结缺陷等，肠道微生物有助于人体自然免疫与适应性免疫的发育成熟。肠道菌群合成多种维生素，如B族维生素（维生素B1、B2、B6、B12），维生素K，烟酸、泛酸等，还能利用蛋白质残渣合成非必需氨基酸，如天冬门氨酸、丙氨酸、缬氨酸和苏氨酸等，并参与糖类和蛋白质的代谢，同时还能促进铁、镁、锌等矿物元素的吸收，其分解肠道的膳食纤维产生的短链脂肪酸是结肠细胞所必需的能量来源。

　　肠道病毒数量大约有108，95％病毒群一生中很少改变，与我们预想的不同，肠道病毒大部分对人体无害，但是其具体的构成及作用仍需要进一步探讨。

　　目前发现许多疾病与肠道菌群的改变有关，如过敏性疾病、自身免疫性疾病、肥胖、糖尿病、克罗恩病等。克罗恩病是在环境因素作用下，机体免疫组织对肠道微生物不恰当的反应所导致的慢性持续的炎症反应。肠道微生物在克罗恩病的发病中起着至关重要的作用，无菌状态下的动物不会发生肠道的炎症。研究显示克罗恩病人的肠道菌群有别于正常人群，其中有易感基因的作用，也有饮食及药物因素的作用，而且已经有研究显示克罗恩病人通过胃管服或吞服正常亲属粪便制作的胶囊可治疗克罗恩病。

　　总之，肠道微生物与我们的身体健康、疾病密切相关，我们对肠道微生物与疾病关系的了解目前只是刚刚揭开面纱，需要更多更深入的探讨。