胰腺炎发病后的前两周内的死亡原因多为全身炎症反应综合症（SIRS）和多器官功能衰竭（MODS），而晚期则主要死于坏死性胰腺炎的并发症。

　　病理生理过程及治疗胆源性胰腺炎的发病机理仍未明。一些研究表明，结石可能压迫远端胆管和胰管之间的组织进而导致胰管阻塞，或者引起共同通道（Vater 壶腹）阻塞使胆汁反流入胰管。这两种机制都可能导致胰管压力增高。

　　胰管阻塞将导致胆汁、胰液反流，胰管高压和腺泡细胞的异常分泌，并进一步导致胰管损伤、胰酶释放至腺体间质内，使胰腺自身消化从而触发胰腺炎。并非所有伴胰管阻塞的慢性胰腺炎患者都会急性发作，因此，急性”堵塞可能是急性胰腺炎发生的重要因素。

　　不考虑刺激性因素，50％ 以上的急性胰腺炎与直径≤5mm 的小结石从胆道排出有关。85％~95％ 的急性胰腺炎患者粪便中能发现结石，这在活动性胆结石（不伴胰腺炎）患者中的比例为 10％。分析 20 世纪 80 年代胰腺炎患者的手术病例可发现，入院后 48 小时内接受手术治疗的患者中，63％ 伴胆管结石，78％ 伴壶腹结石。

　　曾经有人提议，早期经 ERCP 行括约肌切开术（EST）、取出梗阻结石有助于改善胰腺炎病程。事实上，胆汁引流对于某些患者至关重要。然而，不同的临床研究结果显示 ERCP 在胰腺炎中的价值各异，因而，内镜医师面临的问题是如何选择那些能够从 ERCP、EST 获益的患者。