慢性胰腺炎的治疗以控制疼痛、糖尿病和脂肪泻为主。疼痛可能是治疗中最为棘手的难题，内科、外科和内镜治疗均可控制疼痛。
　　1、 内科治疗 包括戒酒、积极治疗胆道疾病、抑制胃酸分泌，必要时补充维生素和中、短链脂肪酸等。胰酶替代治疗可反馈抑制胰腺外分泌，胰酶治疗可尝试作为慢性胰腺炎治疗的起始，特别适用于有小胰管疾病的患者或特发性胰腺炎者，尤其是女性。
　　2、 外科治疗 具有下列适应征者可考虑手术：①内科治疗无效的严重腹痛。②内科及微创外科治疗无效的胰腺囊肿、胰腺脓肿、胰瘘。②合并梗阻性黄疽，十二指肠、结肠梗阻。④可能合并胰腺癌。⑥胰源性门静脉高压症。外科减压术的前提是主胰管扩张。侧向胰腺－空肠造口术是应用最广的胰管减压术，其疗效十分满意。循证医学研究表明，保留十二指肠或幽门的胰十二指肠切除术可缓解90％；患者的疼痛，而且改善患者生活质量。然而对于无胰管扩张者，切除大部分胰头部组织后将导致相当的并发症，并有发生糖尿病和胰腺外分泌不足的长期危险，手术的效果并不满意。但手术仍被视为内科与内镜治疗失败者的有效治疗手段。
　　3、内镜治疗 随着内镜治疗技术的不断发展，胰腺疾病的内镜治疗也已广泛开展，与外科治疗相比，内镜治疗创伤轻，具有较低的死亡率，将其作为缓解胰管梗阻引起腹痛的首选方法已被广泛接受。对胰管狭窄可采用胰管扩约肌切开术（EPS）、气囊扩张术及胰管支架置放术。对胰管结石可行内镜下网篮取石、碎石后气囊取石、体外震波碎石和胰管放置内支架引流。