治疗一般能达到无疣状态，但很多患者还会有病毒滞留在少量上皮细胞中。治疗后的复发率高达40％以上。6个月不复发可为“临床治愈”。复发一般出现在治疗后3个月内，再次治疗或改用其他方案仍会有效，经反复多次治疗，多数患者可控制复发，但也有长期带病毒者，尤其是超过35岁的女性。HPV感染是宫颈癌的高危因素，建议定期做宫颈癌的筛查。