美国波士顿儿童医院做了大量的研究认为：唇腭裂的发生，是基因与外部环境相互作用的结果。通俗的说，就是内因和外因相互作用和影响导致的。
　　唇腭裂并不会直接遗传，但是很多研究表明，在正常人群中，唇腭裂宝宝的出生比例大约为千分之二，但是如果亲属中有一个唇腭裂的基因出现，就会增加这个比例到百分之八左右，有两个唇腭裂的基因出现，就会增加比例到百分之十四左右。也就是说，唇腭裂并不会直接遗传，但是会增加生出唇腭裂宝宝的概率。
　　另一方面，外部环境也起到了很重要的作用，我们都知道，宝宝面部的发育是在怀孕的前三个月就完成了的。那么在这三个月内，妈妈所受到的很多伤害，都会间接导致唇腭裂的发生。研究表明：很多药物，特别是抗生素，会很大程度上导致唇腭裂的发生；另外一些精神疾患，比如说抑郁啊，恐惧啊的也会造成不良的后果；再者，烟草和酒精也被认为是罪魁之一。所以准妈妈们要注意了，保持良好的身体健康和乐观开朗的心情，远离烟草和酒精吧！
　　综上所述，唇腭裂的发生就是基因和环境相互作用而导致的，面部融合和拼接障碍引起的。