偶尔一次睡眠呼吸暂停虽然可引起体内一些短暂改变，但不会对人体的健康造成多大危害，然而这种窒息长期反复发生，夜复一夜，年复一年，其危害就不可等闲视之了。
　　一、心血管系统：
　　1、高血压：40％～60％的阻塞型睡眠呼吸暂停综合征患者有高血压病史，与其他高血压患者不同有是，他们的血压大多在早晨最高，清晨头痛、头晕明显，单纯药物治疗效果差。有效治疗呼吸暂停后，高血压可下降，有的甚至可降至正常范围。
　　2、肺心病、右心功能衰竭：肺动脉高压、10％～20％的睡眠呼吸暂停综合征患会出现肺动脉高压，中、重度睡眠呼吸暂停综合征患者肺动脉高压的患病率可达55％，在合并有肺部疾患(如慢性支气管炎、肺气肿)，睡眠呼吸暂停更易导致肺动脉压升高，加重右心室及右心房的工作负荷而出现肺心病、右心功能衰竭，主要表现为腿肿、气短。
　　3、左心功能改变：超声心动图及尸体解剖发观，长期发生睡眠呼吸暂停可以使左心重量增加、心室壁增厚、心脏每次搏动射出的血量减少。
　　4、缺血性心脏病：缺血性心脏病主要包括心绞痛、心肌梗死，缺氧是引起心绞痛的重要原因。研究表明，睡眠呼吸暂停性心脏病发病的危险因素之一。动态心电图检查发观，睡眠呼吸暂停综合征患者在睡眠过程中的ST段下降的发生十分颁繁，提示心脏缺血缺氧。尤其是原有心脏病的患者，呼吸暂停引起的缺氧，自主神经功能紊乱、合并高血压等因素会加速动脉硬化的发展，诱发心绞痛甚至心肌梗死。
　　5、心律失常：睡眠呼吸暂停综合征患者睡眠时心率快慢交替，心率波动幅度较大，多为窦性心动过速，但也有短阵房性或室性心动过速，慢者出现心脏传导阻滞、心脏停跳，几乎有一半的睡眠呼吸暂停综合征患者会出现各种各样的心律失常，有些甚至是致命的。单纯治疗睡眠呼吸暂停常可取得良好效果。但易被误诊为心脏病而误冶。
　　二、神经系统：
　　1、脑血管病：我们都知道，脑血管意外即通常所说的中风好发于夜间，一夜之间，病人就会口眼歪斜，肢体瘫痪。研究发观，睡眠时打鼾及呼吸暂停可以增加脑血管病的发病率及死亡率，53％以上的男性脑血管患者有长期习惯性打鼾史，35％的患者脑血管意外发作在睡眠时，与打鼾。及呼吸暂停密切相关。越来越多的证据表明，打鼾及呼吸暂停是脑血管病的一个独立危险因素，对脑血管意外的发生及病情加重有十分重要的作用。
　　2、过度嗜睡：睡眠呼吸暂停引起的频繁觉醒会严重扰乱患者的睡眠，深睡期减少甚至消失，患者长期处于睡眠不足的状态。白天嗜睡的严重程度与睡眠呼吸暂停综合征的严重程度密切相关。白天困倦嗜睡，会严重影响工作、学习、生活，尤其是司机、从事高空作业的患者，意外事故发生率很高，可危及他人的生命安全。
　　3、精神及心理危害：智力减退、性格及行为异常，与睡眠呼吸暂停综合征的关系已十分明确：睡眠呼吸暂停综合征患者与家庭成员、同事间的人际关系常不太融洽：抑郁症等精神疾病也可见于睡眠呼吸暂停综合征患者：有的研究还发现，睡眠呼吸暂停现老年痴呆症的发生也有一定关系。
　　三、内分泌代谢系统：性欲减退或阳痿在男性睡目民呼吸暂停综合征患者中较为常见。统计资料表明，50例睡且民呼吸暂停综合征患者中，44％的有不同程度的性机能障碍，近采的研究还表明，睡眠呼吸暂停引起的内分泌代谢机能紊乱，可以加重肥胖。
　　四、血液系统：很多睡目民呼吸暂停综合征患者血中的红细胞增多，血红蛋白大于每升160克，超过正常范围，血液粘稠度增加，这是由于长期呼吸暂停引起机体缺氧，血液中的红细胞为了更多地携带氧气而代偿增生所致，机体内其它内分泌激素含量的变化而起的排尿增多致血液浓缩等因素也是造成血中红细胞增多的重要因素。
　　五、肾脏功能：睡眠呼吸暂停综合征患者夜间睡眠时尿量增多，次数可达3次以上，部分患者尿中蛋白含量增加。