GERD的症状容易与很多其他疾病混淆，患者往往意识不到自己已经患了该病，即使知道也因对该病缺乏了解而没有引起足够的重视。
　　GERD的危害包括降低患者生活质量，造成各种并发症，甚至癌变、死亡。
　　GERD的各种症状，都会反复发作，造成患者生活上的长期困扰，而且往往夜间更明显，影响睡眠，让人烦恼，而因疾病而恶化的心理、精神状态又会加重疾病，造成恶性循环。
　　GERD若不及时治疗，会带来并发症，如哮喘、吸入性肺炎、肺纤维化、中耳炎、食管狭窄等，使患者承受更多痛苦，生活质量更差。很多GERD是食管裂孔疝造成的，严重的食管裂孔疝如不手术，可能导致胃的坏死、穿孔，造成极严重的后果。
　　GERD时胃酸和胆汁反复刺激食管粘膜，导致其糜烂、溃疡，久而久之，会导致食管癌的发生。
　　当反流的胃酸进入气管后，会引起严重的呼吸道反应，甚至可能导致患者发生喉痉挛而死亡。