遗传因素可能使早泄患者产生易患病的体质。在Bernhard Schapiro经典的研究中，家庭成员中患早泄人数多的人易患早泄。Waldinger等研究再次证实了原发性早泄的IELT是遗传决定的，在一原发性PE病人14个一级亲属中有10个同样患有PE，并且其射精潜伏时间＜1min。因此，PE的病因中可能也有基因参与。

　　Jern P等对3946例双胞胎的（18～48岁，平均年龄29.9岁）研究发现：在PE发病中遗传因素为中度遗传倾向（28％），更进一步的研究评估了5-羟色胺转运体基因的基因型，该基因型的多形性与PE的发生有着一定的关系，同时这也与应用SSRIs治疗PE有关。动物实验显示缺乏内皮型一氧化氮合酶基因小鼠发展为PE症状，而缺乏血红素氧合酶基因G2会导致延迟射精和不射精。