肾癌预后分析系统则具有良好的操作性，可以将风险分级并预测生存率，也有助于临床试验设计和制定随访策略。开发使用分子标志物预后分析系统是肾癌预后分析的发展趋势。
　　一.UISS
　　加利福尼亚大学洛杉矶分校（University of California，Los Angeles UCLA）的科研人员开发了肾癌风险分级系统，即UISS(University of California, Los Angeles Integrated Staging System)。依据肾癌TNM分期（1997）、肿瘤病理分级（Furhman Grade）和ECOG生活质量评分，UISS将肾癌分成5组，这5组患者的预后差异具有显著性。采用UICC （UCLA Integrated Staging System）分期系统对这些患者进行分层，分为三个不同危险的组即低危险、中等危险和高危险。对局限性肿瘤而言，低危险组5年存活率为92％；中等组为67％；而高危险组仅为44％。转移性肾癌患者其3年生存率：低危险组为27％；中等危险组为23％；而高危险组为12％，高危险组生存率的变异性最大。UISS被证明是非转移肾癌生存率的准确预测因素，但对转移性肾癌其预测准确性欠佳。UISS的缺点之一是它不能提供具体的可能性的值，而仅能将不同患者区分成低、中、高风险组群。因此相比于其他系统，对于指导治疗而言，UISS提供的信息意义要小一些。
　　二.SSIGN
　　2002年梅奥临床中心（Mayo Clinic）回顾分析了1800多个肾癌病例，开发出一套肿瘤分期（Staging）、肿瘤大小（Size）、肿瘤病理分级（Grade）以及肿瘤坏死（Necrosis）的评分系统（SSIGN）。根据SSIGN分数，可以估计患者1～10年生存可能性。
　　三.Nomogram
　　2001年，斯罗恩-凯特林纪念癌症中心（Memorial Sloan-Kettering Cancer Center MSKCC）回顾分析了601例肾癌术后患者，并在此基础上开发了评估肾癌术后的诺摩图（POSTOPERATIVE PROGNOSTIC NOMOGRAM FOR RENAL CELL CARCINOMA）。该图用来预测新诊断的肾癌患者五年无瘤生存的可能性；2005年斯罗恩-凯特林纪念癌症中心（MSKCC）在此基础上进一步将患者数量增加至833例，并开发了评估肾透明细胞癌复发诺摩图（NOMOGRAM FOR RECURRENCE OF CLEAR CELL RENAL CELL CARCINOMA）。该图用来预测肾透明细胞癌患者五年无瘤生存的可能性。以诺摩图为依据，结合诺摩图软件可以使预后分析更精确高效。