生殖器疱疹的主要传染源是生殖器单纯疱疹病毒（HSV）感染患者和带毒者，包括有或无临床症状或不典型生殖器疱疹患者。大多数生殖器疱疹患者是在与性伴发生性接触时感染上该病的，而这些性伴通常不知道自己感染了HSV。有皮损和症状时，传染性强；无症状感染者及复发性生殖器疱疹复发间歇期存在排毒，也有一定传染性。HSV感染是通过人群与易感者之间的密切接触。HSV一1型常由飞沫和唾液传播，而HSV一2型主要通过性传播和垂直传播。性接触传播包括生殖器性交、口交和肛交，这是该病的主要传播途径。垂直传播是指母婴间传播，包括子宫内感染和经产道感染。HSV传播主要出现在与有病毒排放的感染者发生密切接触时，病毒存在于感染者感染部位的黏膜表面和生殖道或口腔分泌物中。