无论是膜周型室间隔缺损还是肺动脉瓣下型室间隔缺损，如果直径较大必然造成大量血流从左心室向右心室分流，导致肺动脉高压和心功能下降，甚至因肺炎与心力衰竭导致死亡。对于这部分患儿应尽早手术治疗以避免因室间隔缺损所导致的各种并发症和生命危险，大大提高患儿的生活质量。
　　目前，随着心脏手术的技术和设备、体外循环、麻醉以及手术后监护水平的迅速提高，这部分患儿完全可以在一岁以内完成室间隔缺损的修补手术。
　　但必须指出，尽早手术也是有前提的，即患儿必须在肺炎基本治愈、心力衰竭基本缓解时接受手术治疗才能保证手术的成功率。
　　对于直径较小的肺动脉瓣下型室间隔缺损，如无明显症状，建议在1周岁前完成室间隔缺损的修补手术，因为随着年龄的增长，主动脉瓣也会受室间隔缺损的影响而产生病变，大大增加手术的风险和难度。
　　对于直径较小的膜周型室间隔缺损，如到学龄前仍未“长好” 则须接受手术治疗或介入治疗。在开展儿童先心病手术治疗较多的医学中心（如北京安贞医院，上海儿童医学中心等），手术修补完全不受年龄限制，小到一两个月(甚至生后数天)，如病情需要，都能进行室间隔缺损的手术治疗。