角膜炎目前多按病因分类，如感染性、免疫性、营养不良性、神经麻痹性及暴露性角膜炎等。其中感染性角膜炎有可按照致病微生物不同分为细菌性、病毒性、真菌性、棘阿米巴性和衣原体性等。
　　（1）细菌性角膜的致病菌主要有葡萄球菌、绿脓杆菌、肺炎链球菌等。由于致病菌种的变迁，一线用药也在发生变化。目前，表皮葡萄球菌感染性角膜炎正在逐年增加，微球菌的检出率增高，提示条件致病菌的感染比例增加的趋势。初诊的细菌性角膜炎可以根据临床表现，溃疡严重程度给予广谱抗生素治疗，然后根据细菌培养+药敏调整用药。Gram’s阳性菌感染首选万古霉素眼液，Gram’s阴性菌感染首选氨基糖甙类眼液，氟喹诺酮类眼液对Gram’阴性菌和许多Gram’s阳性菌都有抗菌作用，对耐药葡萄球菌也有作用，但有学者认为，单独使用氟喹诺酮类抗菌素易导致耐药，应尽量避免单一使用。用药的频度可根据感染严重程度调整，严重病例可频点，眼膏剂型和凝胶剂型可增加药物在眼表的停留。并发虹膜睫状体炎时可加用1％阿托品眼液散瞳，减轻虹膜炎症反应。
　　（2）对于真菌性角膜炎，目前的用药包括0.15％二性霉素和5％那他霉素，每1/2-1h滴用一次，增加病灶区药物浓度，配合晚间抗真菌眼膏，感染控制后可减少用药次数。并发虹膜睫状体炎时，可加用1％阿托品眼液散瞳，禁用皮质类固醇眼液。
　　（3）对于单纯疱疹病毒性角膜炎，常用的药物有无环鸟苷，环胞苷，三氮唑核苷、更昔洛韦等，分别有眼液和眼膏剂型，急性期每1-2小时点眼一次，晚间涂抗病毒眼膏，上皮型者控制病情的发病机理是由于病毒在上皮细胞内活化复制，因而必须给予有效的抗病毒药物抑制病毒的活力，慎用激素；基质型角膜炎以机体的免疫炎症反应为主，因此出抗病毒外，抗炎治疗更为重要，一般临床上在抗病毒治疗的同时，采用激素治疗，但也有学者认为免疫功能正常者，通常有自限性，激素的使用增加了细菌/病毒的超级感染，角膜溶解、青光眼等严重并发症。内皮型角膜炎的治疗在抗病毒、抗炎的同时，还应该积极采取保护角膜内皮的治疗措施，神经营养性角膜病变多出现于恢复期，治疗上包括使用不含防腐剂的人工泪液保护眼表湿润，用抗生素滴眼液及眼膏防止感染。