人是由人体和共栖共生微生物构成的超级生物体，人类基因组的解码对于全面了解人体生物学功能是远远不够的，必须考虑聚集在人体体表和体内的，与人类长期共栖共生的微生物对人类的影响。肠道微生物几乎与人体各个系统的疾病关系密切，肠道微生物在人类疾病发生发展中所起到的作用越来越引起人们的重视，肠道微生态改变是疾病的始动因素，还是疾病发生后引起的改变目前仍不明确。
　　溃疡性结肠炎（UC）是一种病因尚不明的，直肠、结肠黏膜的慢性非特异性炎症性疾病。该病通常反复发作、迁延不愈，临床上目前仍无特效性的治疗手段。近年的研究认为肠道微生物及其代谢产物、宿主基因易感性以及宿主肠道粘膜天然性或者获得免疫应答失衡三方面共同参与了IBD 的发病机制。
　　目前诸多研究已经证实UC患者与健康个体的肠道微生物种类和丰度存在差异，UC患者肠道微生物多样性较健康人群显著降低。
　　人群肠道微生物构成和数量均发生改变，目前较为一致的结论有：
　　1、肠道中优势菌群含量显著降低；
　　2、 肠道微生物总体的多样性和稳定性普遍降低；
　　3、肠道乳杆菌和双歧杆菌等益生菌种含量降低；
　　4、 粘膜相关微生物对人体宿主的作用更直接，而粪便样本微生物决定了肠道微生物的代谢产物，两者间微生物构成和数量无显著差别；