唇腭裂患者的治疗是一个系统工程，正畸治疗贯穿始终。对于完全性唇腭裂患者，唇裂修补术前可进行鼻牙槽塑形（PNAM）治疗；混合牙列早期可进行颌骨矫形治疗以及植骨手术前的牙弓形态规整治疗；植骨术后（混合牙列末期或恒牙列早期）进行常规正畸治疗。很大部分患者经上述序列治疗均已获得可观效果，往往可免除正颌手术的需求。对于颌骨发育严重障碍的部分患者在16周岁左右进行正颌手术前的正畸治疗。