1、治疗原则：
　　治疗方案设计根据患者年龄、生育要求、症状、病变部位及严重性，全面考虑，个体化设计。
　　有生育要求或因为内异症不孕，病变轻者可以先选择药物治疗；年轻病变严重者采用保留生育力手术。
　　年轻无再生育要求的严重患者，可以选择保留卵巢功能手术。
　　年长已生育病情严重患者，可以选择根治性手术。
　　2、 治疗方案：
　　期待（随访）：轻度子宫内膜异位症患者可以随访观察。
　　止痛：内异症患者常常有痛经症状，可以生育非甾体类消炎药（消炎痛、布洛芬），或者普通止痛药（散利通）等，严重痛经往往无效。
　　激素类药物：
　　短效避孕药：如妈富隆，达因35等，抑制卵巢功能，抑制子宫内膜和异位内膜生长。一般疗程为3－6月。
　　孕激素：也称假孕疗法。常用药物有妇康片（炔诺酮），抑制卵巢功能，抑制子宫内膜和异位内膜生长。一般疗程为3－6月。
　　达那唑：也称假绝经疗法，属于睾酮衍生物，抑制脑垂体释放促性腺激素，封闭卵巢功能，抑制子宫内膜生长。一般疗程为3－6月。
　　孕三烯酮（内美通）：睾酮衍生物，对抗雌激素和孕激素，抑制子宫内膜生长。一般疗程为3－6月。
　　GnRH-a：也称药物性趋势（卵巢切除），常用药物达菲林，抑制脑垂体分泌促性腺激素，抑制卵巢功能，抑制子宫内膜。
　　手术治疗：手术目的：清除内异症，缓解症状。
　　（1）手术指征：有一下情况患者可以考虑手术治疗
　　药物治疗无效，或病情加重。
　　卵巢巧克力囊肿直径>5cm
　　迫切要求生育
　　重度内异症
　　CA125等肿瘤相关指标升高患者，提示内异症生长活跃，也是内异症恶变的高危因素，可以放宽手术指征，适当提前手术时间
　　手术后复发性内异症
　　（2） 手术技术
　　腹腔镜手术：目前月经作为子宫内膜异位症治疗的首选方式。主要优点：手术微创，清除内异症病灶彻底。
　　剖腹手术：传统手术。
　　（3） 手术方式
　　保留生育力手术：清除盆腔内异症病灶，包括巧克力囊肿，保留子宫及卵巢。
　　骶神经阻断术：年轻选择保留生育力患者，痛经症状严重可以做骶神经阻断术。
　　保留卵巢功能手术：45岁以下严重内异症患者，可以考虑切除子宫、输卵管，清除盆腔内异症病灶，保留双侧、或一侧、或部分卵巢。
　　根治性手术：适合45岁以上严重内异症患者，手术切除子宫、卵巢、输卵管，清除盆腔内异症病灶。
　　3、预防措施：
　　经期保健：子宫内膜异位症被认为是经血倒流至盆腹腔引起，携带有子宫内膜碎片的月经血经输卵管倒流到盆腹腔，在一定的条件下内膜成活，生长，形成子宫内膜异位症。所以经期保健十分重要，经期应该避免激烈活动、性生活、生冷饮食、刺激性饮食等
　　避免手术操作：人工流产、刮宫等宫腔操作可以导致子宫内膜进入腹腔，引起内异症。
　　避孕药：避孕药使用可以减少内异症发生。
　　内异症术后复发：子宫内膜异位症手术后复发率较高，复发原因与多种因素有关，其中手术因素关系密切，涉及手术方式，手术质量。保守性手术（保留生育力、保留卵巢功能）患者术后可以使用3个月药物治疗，低于降低复发有帮助。希望生育患者术后应该尽可能早获得妊娠，妊娠本身可以抑制内异症病灶生长，降低复发。自然妊娠失败或者无自然妊娠可能患者，可以采用辅助生殖技术，如人工授精，试管婴儿等。从术后内异症复发角度上讲，成功妊娠是很好的预防复发措施。