对于特发性间质性肺炎，推荐进行外科肺活检或胸腔镜肺活检，并且尽可能的进行多点活检，这样才能确保不因疾病的异质性而导致诊断出现偏差。

　　由于上述活检花费高，损伤大，国人较少愿意进行这方面的检查，因此在多数医院进行支气管镜检查、CT引导下经皮肺活检等手段代替外科或胸腔镜手术检查。实际上这些检查的价值不是其诊断意义，而是在于排除其它疾病的可能性。

　　需要说明的是，对于某些典型的特发性间质性肺炎类型比如IPF，有经验的肺科医生是可以根据临床、影像学给出较为肯定的诊断的。IPF指南中就确认了临床、影像学的诊断价值。