目前对先天性心脏病治疗方法主要有两种：外科手术治疗与内科介入治疗。
　　一、外科手术：包括以下两种方法：
　　1、 开胸手术：为主要治疗方式，适用范围较广，能根治各种简单、复杂先天性心脏病，但一般需要体外循环及全麻，术中需要切开胸骨和心脏，对身体有一定的创伤，且术中一般需要输血，术后恢复时间较长，少数病人可能出现心律失常、胸腔、心腔积液等并发症，还会留下手术疤痕影响美观。
　　2、 微创封堵：近几年兴起的一种手术方法，切开胸壁和心脏，在超声监测下置入封堵器，手术时间短，不需要输血，术后恢复快，但胸壁仍遗留疤痕。
　　二、介入治疗
　　介入治疗是目前世界上治疗先天性心脏病的最先进的一种方法，治疗时医生细小的特制的穿刺针穿刺病人血管(通常取右侧大腿股静脉或/和股动脉)，通过特制鞘管，在DSA的引导下，将大小合适的封堵器送至病变部位封堵缺损或未闭合的动脉导管，或用大小合适的球囊扩张狭窄的瓣膜，主要适用于室间隔缺损、房间隔缺损（继发孔型）、动脉导管未闭、肺动脉瓣狭窄、主动脉瓣狭窄等简单心脏病，手术时间短，一般半小时至1小时，不需要体外循环，学龄期儿童及成人局麻下即可进行，术中不需输血，术后恢复快，12小时后可下地活动，2天后可出院，术后不留任何疤痕。
　　介入治疗适用范围同微创封堵术，但比后者更优越，因为创伤小，不留任何瘢痕。不合并其他需手术矫正的心脏畸形患儿应优先考虑行介入治疗。