由于系统性红斑狼疮的病因不明，目前尚没有特效药，而且各患者的具体表现不一样，故治疗应个体化。下面介绍几种常用于治疗系统性红斑狼疮的药物：
　　1、非甾体抗炎药：常见的双氯芬酸、塞来昔布、布洛芬、芬必得、消炎痛、扶他林等都属于此类药，用于发热、关节肿痛、肌肉痛等症状的对症治疗。
　　2、糖皮质激素：此药仍是治疗系统性红斑狼疮的主要药物，目前常用药为：强的松（5mg/片），甲泼尼龙（4mg/片）。激素药适用于急性活动性病例，特别是急性爆发性狼疮、急性狼疮性肾炎、急性中枢神经系统狼疮及合并严重的贫血、白细胞及血小板减少。但必须强调一定要在控制疾病活动的情况下尽量减少用量，但不能突然停药，以免病情加重。
　　3、抗疟药：主要有氯喹和羟基氯喹，对于控制皮肤损害（蝶型红斑、盘状红斑）、光过敏、关节炎很有效，但起效慢，需较长时间服药才见效。
　　4、免疫抑制剂：对于单纯使用糖皮质激素不能控制病情的患者，及有较严重的肾损害、神经系统损害的患者均应考虑应用免疫抑制剂。目前最常用的是环磷酰胺，其副作用有骨髓抑制、降低免疫功能、性腺抑制等，所以用药时注意复查肝功和血常规。其他可选择的免疫抑制剂有硫唑嘌呤、甲氨喋呤等。
　　5、中医药治疗：中西医结合治疗有利于提高疗效，临床应用较多的传统中成药有雷公藤，应在医生指导下使用。服用中药期间不能擅自停用激素，以免加重病情。