再障发病与五脏均有密切关系，但以“心”为核心，从根本上讲其机制不离“心火”的变化。由于心为火脏，是阳中之太阳，故心火既易亢而为邪火，又易亏而为不足，盈亏难以自调则功能紊乱。
　　当然，肝主藏血，能调节循环血量；脾主运化，为后天之本，上奉造血的水谷精微，并且脾主统血，与心脉协同共同完成血液正常运行。
　　肾为先天之本，主藏精，精能化生血液；肺朝百脉，主宗气，布血于周身。其他诸如六腑、奇恒之腑在一定程度上也与血的生成及其功能有直接和间接的关系，但总以肝脾肾关系较为密切。就血的生成及质量而言，心是关键。
　　《血证论》载：“心之能事，又主生血，而心窍中数点血液则又血中之最精微者，乃生血之源泉，亦出神之渊海。”就其数量而言，与脾关系至为密切，因为脾主运化，制造造血所需精微。
　　“伏火”与心之少火同气相求，基于心“主生血”的少火乏力，伏火乘虚而入，伏于少阴心脉，就形成中医再生障碍性贫血的总病机。
　　再障从根本上讲以本虚为主，但多因实致虚。再障的形成多因虚招致伏火内蕴，煎阴耗血，逐渐发展而成，究其原因有伏火损伤少火，真血无以生。
　　伏火损伤脾阳，营血失源，化生血液不足等。一旦血供不足，首先会加剧伏火，导致火邪炽盛，迫血妄行，导致出血；其次伏火流窜，传至厥阴，会因起发热。
　　再次煎阴耗血，形成伏痰、伏瘀，痰瘀阻络，证见心肺诸脏腑及肢体经络病变；更有甚者，风自内生，风火相煽，形成中风、震颤诸证。病久伏火食气，阳气虚衰，阴竭津枯，阴阳两虚，甚至阴阳离决的危重证，预后不良。
　　再障的传变规律基本符合三阴传变规律，即一般地讲，伏火潜于心少阴是血液病发病的初始态病机要点，之后会外出心包厥阴经，之后肺太阴经，这符合伏火传变的一般特点，称之为顺传，反之为逆传；但也常常出现心少阴先传变至肾少阴，心包厥阴先传变至肝厥阴，或后肺太阴传变至脾太阴。
　　这种从上向下传，称之为逆传，反之为顺传。但也会见到各经之间的越传，往往能反映疾病的突变。总之，伏火在再障疾病中基本按少阴、厥阴、太阴的顺序变化。