HLA-B27在脊柱关节病的发病中发挥作用，这一点已广泛认同，但必须注意只有少数HLA-B27阳性者患病。目前，强直性脊柱炎的诊断主要依靠临床表现及骶髂关节X线片资料，HLA-B27既不能用于强直性脊柱炎的确诊，也不能预见患者预后，即HLA-B27阳性者，不一定必然发生强直性脊柱炎;而HLA-B27阴性者，也不一定不会发生强直性脊柱炎。

　　(1)如果症状和体征提示患者强直性脊柱炎的可能性超过50％，那么HLA-B27阳性会显著增加正确诊断的机会。

　　(2)患炎性关节病变的儿童，HLA-B27阳性可提示可能会发生强直性脊柱炎。

　　(3)如果强直性脊柱炎患者的子女HLA-B27阳性，尤其是男性，提示其发生强直性脊柱炎的可能性较大。

　　(4)有腰背痛的患者，HLA-B27阴性不利于诊断强直性脊柱炎，在不伴有银屑病和炎症性肠病时，HLA-B27阴性几乎可作为排除强直性脊柱炎的条件之一。

　　(5)HLA-B27阳性的银屑病或炎症性肠病患者有可能并发强直性脊柱炎。

　　(6)与HLA-B27阴性的强直性脊柱炎相比，HLA-B27阳性者发病相对较早、临床症状较重、全身症状及外周关节炎(如髋关节等)的发生率较高，免疫学指标改变 (ESR、CRP和γ-球蛋白增高)较多，家族聚集现象、竹节样脊柱和眼炎的发生率也较高， 即HLA-B27阳性的患者的病情较重，预后欠佳。而HLA-B27阴性患者则多伴银屑病、溃疡性结肠炎或克罗恩病。

　　(7)HLA-B27在强直性脊柱炎的预防与治疗中尚无具体应用，或许有用于预防的可能性，如能在羊水细胞HLA分型确定胎儿携带致病基因时，可作治疗性流产，还可用细胞毒性HLA抗体杀灭携带致病基因的精子，防止致病基因的传递。

　　总之，HLA-B27为诊断强直性脊柱炎的参考指标，并非诊断依据。若已经X线等影像学证实诊断为强直性脊柱炎的患者，可不再行HLA-B27检查。