内科胸腔镜的使用范围非常广泛，既可用于疾病的诊断也可用于治疗。首先癌性胸腔积液是内科胸腔镜的主要诊断和治疗适应征，可以说，内科胸腔镜对任何类型恶性胸腔积液的诊断率都是非常高的。例如转移性恶性胸腔积液，运用壁层胸膜的盲检确诊率低，大约30％的患者壁层胸膜常常检查不出来。而在胸腔镜下可直接见到脏层及壁层胸膜上的病灶进行活检确诊。同时可在内科胸腔镜下同时进行进行胸膜固定术控制恶性胸腔积液的再增长。其次是对结核性胸腔积液的诊治，确诊率几乎可达100％，对广泛形成胸膜粘连、分房等有慢性倾向结核性胸膜炎术中可予以清理粘连带、消灭包裹腔，清除积液、坏死组织，恢复肺功能，为患者解除了病痛。第三内科胸腔镜对脓胸患者疗效更加突出，胸腔镜治疗后可迅速退烧减轻症状。第四胸腔镜可用于难治性气胸的诊断和治疗。对普通引流效果欠佳的自发性气胸患者、反复多次气胸或合并液气胸、血气胸的患者，需尽快行胸腔镜检查，这有助于了解脏层胸膜下肺大泡、支气管胸膜瘘及肺破裂口的大小，为下一步治疗提供依据。
　　目前胸腔镜包括内科胸腔镜及外科胸腔镜，主要区别有以下几方面：首先，内科胸腔镜由肺科医生或呼吸内镜医生在内镜室完成，而外科胸腔镜主要是电视辅助胸腔镜手术（VATS），是由胸外科医生在手术室进行。其次，内科胸腔镜采用局部麻醉（或加用静脉镇静）来完成，患者容易耐受；外科胸腔镜则需要全身麻醉、双腔气管插管来保证患侧操作。第三，内科胸腔镜很少使用一次性用品，不需全身麻醉，费用明显低于外科胸腔镜。第四，内科胸腔镜由于视野小，因此主要用于诊断、黏连松解和胸膜固定，而外科胸腔镜可完成病灶切除和黏连严重的胸膜松解等操作。