1、一般肾病综合征患者单用激素疗效就很好的话，就不需加用其他的免疫抑制剂。治疗肾病综合征的免疫抑制剂有环磷酰胺，环孢素A，霉酚酸酯，硫唑嘌呤，他克莫司，来氟米特等。环磷酰胺是比较传统和经典的药物，是激素无效或依赖患者的肾病综合征非常常用的免疫抑制剂。环孢素A，霉酚酸酯，他克莫司等比较昂贵。
　　2、微小病变和膜性肾病患者，如经济条件允许或患者年轻需要生育，可以应用霉酚酸酯  （商品名骁悉）或环孢素A. 新的临床试验结果表明应用他克莫司治疗膜性肾病也有一定疗效。
　　3、局灶节段肾小球硬化患者多需要激素和环磷酰胺联用，如环磷酰胺无效或担心性腺毒性，可以用环孢素A。
　　4、狼疮性肾炎及ANCA相关性小血管炎的患者诱导治疗（就是疾病尚未缓解）需要激素和环磷酰胺联用。在病情维持稳定时的维持治疗可以选用硫唑嘌呤，1-2mg/Kg/天， 但要注意此药如用至100 mg/天，很多患者会出现白细胞下降。疾病尚未缓解期还可选用激素和骁悉联用，也有用他克莫司来治疗。
　　5、来氟米特（商品名爱若华）最早用来治疗类风湿性关节炎，近来尝试治疗狼疮性肾炎，也有些学者用来尝试治疗 IgA肾病，FSGS（局灶节段肾小球硬化）。
　　6、雷公藤多甙是中药雷公藤提取的制剂，具有一定的免疫抑制作用，有些学者认为对紫癜性肾炎有一定疗效，对肾小球肾炎减少尿蛋白也有一定的疗效。但由于它也具有肝损害，性腺抑制，白细胞下降等副作用，现在逐渐被AECI和ARB类的药物替代。