儿童慢性乙肝病毒感染者多处于免疫耐受期，大部分无明显症状，可暂不行抗病毒治疗，但须定期随访观察。但也有少数感染儿童发病较早，出现肝功能异常等临床表现，甚至导致不能正常上学，这样的儿童是应该考虑抗病毒治疗的。
　　但由于儿童患者年龄小，治疗可供选择药物较少，因此应严格治疗适应证，其治疗指征与疗程可参考成人患者。在美国，目前食品药品监督管理局（FDA）已批准用于儿童患者治疗的药物包括普通干扰素IFNα（2-17岁）、拉米夫定（2-17岁）与阿德福韦酯（12-17岁）。而且国外研究显示，儿童抗病毒的疗效于成人相似。
　　在我国，2010版《慢乙肝防治指南》规定：
　　12岁以上（体重≥35kg）的慢性乙型肝炎患儿，可以用干扰素治疗。其普通干扰素IFNα治疗的适应证、疗效及安全性与成人相似，剂量为3-6MU/m2体表面积，最大剂量不超过10MU/m2体表面积。同时，在与患儿及其父母充分沟通了解药物相关收益及风险并知情同意的前提下，也可按成人的剂量和疗程使用拉米夫定或阿德福韦酯治疗。当12岁以上患儿应用拉米夫定发生耐药变异时，可考虑联合阿德福韦酯治疗。
　　对于2-11岁的患儿，我国《指南》无明确推荐，应在与患儿及其家长充分沟通了解药物相关收益及风险并知情同意的情况下，使用普通干扰素IFNα或拉米夫定进行抗病毒治疗。干扰素用法同上述12岁以上患儿，而拉米夫定每日用量根据国外经验可按体重计算，即3mg/kg，最大不超过成人剂量。