泌尿系统疾病引起的血尿，可以分为内科性血尿及外科性血尿两大类，前者主要由各种肾小球肾炎引起；后者则由泌尿系统肿瘤、结石、结核、畸形、外伤等疾病导致。医生会先对血尿种类做初步区分（初筛），再指导患者去内科或泌尿外科进行详细检查。
　　外科性血尿于内科性血尿可按如下方法进行初步区分：外科性血尿是病变部位血管破裂造成，常伴血丝及及血块，且血尿变化迅速，由于小血管破裂常能迅速止血，故患者在几次肉眼血尿后尿色即可能转清，而后镜下血尿也完全消失；而肾炎血尿是肾小球基底膜断裂、红细胞漏出导致，不会伴血丝及血块，而且因为基底膜断裂很难修复，血尿不可能迅速消失，即使排几天肉眼血尿后尿色转清，镜下血尿仍常存在。
　　相差显微镜有助于两者的判别，内科性血尿及外科性血尿的尿红细胞形态不同。变形红细胞血尿提示为内科性血尿；而均一红细胞血尿提示为外科性血尿。