疾病分类：临床上一般将肛瘘分为以下两类：单纯性肛瘘：是指肛门旁皮肤仅有一个外口。复杂性肛瘘 是指在肛门内、外有三个以上的开口;或管道穿通两个以上间隙;或管道多而支管横生;或管道绕肛门而生，形如马蹄者，称为马蹄型肛瘘。1975年全国首届肛肠学术会议制定肛瘘的统一分类标准，以外括约肌深部划线为标志，瘘管经过此线以上为高位，在此线以下为低位，

　　其分类如下:

　　(1)低位单纯性肛瘘 只有一个瘘管，并通过外括约肌深层以下，内口在肛窦附近。

　　(2)低位复杂性肛瘘 瘘管在外括约肌深层以下，有两个以上外口，或两条以上管道，内口在肛窦部位。

　　(3)高位单纯性肛瘘 仅有一条管道，瘘管穿过外括约肌深层以上，内口位于肛窦部位。

　　(4)高位复杂性肛瘘 有两个以上外口及管道有分支窦道，其主管通过外括约肌深层以上，有一个或两个以上内口者。另一种分类方法是根据瘘管与括约肌的关系分为：

　　(1)粘膜下肛瘘

　　(2)括约肌间肛瘘

　　(3)经括约肌肛瘘

　　(4)括约肌上肛瘘

　　(5)括约肌外肛瘘。