国家心血管病中心阜外医院近年来与国内多个知名慈善组织开展广泛合作，对先天性心脏病患儿进行救助，成绩斐然，不仅解除了上千名患儿的病痛，还帮扶了他们的家庭。目前，和阜外医院达成慈善救助合作意向的基金会达10家，开展规模化救助的也已经有6家。对于在阜外医院就诊的复杂先天性心脏病患儿，基金会能够给予较大力度的资助，对于少数病情极重、家庭极其困难的患儿，还可同时申请多项慈善救助，极大减轻家庭的负担。而对于简单先天性心脏病患儿，慈善资助加上当地医保或农合的报销能将自负费用降到极低的比例、甚至等同于免费治疗。北京阜外医院小儿心脏外科李守军

在阜外医院小儿外科中心，设有小儿先心病就诊绿色通道，有专门的医生负责接诊，有专职的工作人员负责慈善基金的申请、进度监控及最后的结算，家长只需提交相应的材料即可，其他均由工作人员操作，为家长节省了时间和精力。医疗技术和慈善基金在阜外医院交汇的力量极大的推动了先心病、尤其是贫困儿童先心病的治疗，为他们带来了福音。