胰腺是重要的消化器官，胰腺的疾病如胰腺炎和胰腺癌对人们健康的危害很大，特别是胰腺癌，号称“癌中之王”，出现症状后往往生存期不足一年。由于胰腺在体内的位置较“隐蔽”――位于腹膜后，常规超声检查易受到胃肠内气体和内容物的影响，而较难看清胰腺，所以对胰腺疾病的诊断常须借助CT和磁共振。超声内镜则可以在体腔内最靠近胰腺的部位――胃和十二指肠内近距离、随心所欲的观察胰腺，其对胰腺癌的诊断能力略高于高分辨率增强CT，对胰管和胆总管结石的诊断能力则明显高于CT和磁共振。最重要的是超声内镜下可以进行穿刺活检，获得病理学诊断结果。

　　超声内镜下还可以对胰腺疾病进行治疗，如重症胰腺炎后胰腺假性囊肿的穿刺引流，晚期胰腺癌的镇痛治疗，以及对晚期胰腺癌的局部注射和放置放射性粒子治疗。超声内镜下对胰腺癌的治疗可以显著改善患者生活质量，并一定程度上延长生存期。超声内镜下的诊断和治疗是近年来消化内镜微创技术中发展最迅猛的领域之一。