骨疡型和胆脂瘤型中耳炎必须手术方能治愈，如果能够耐受麻醉，应该尽早手术。单纯性中耳炎鼓膜穿孔小者干耳后可能自愈，穿孔不愈合者也应及时行鼓室成形术，以保留或改善听力。以往手术治疗的目的在于控制中耳感染以及预防严重的中耳炎并发症。近年来手术技术的革新能够使大多数病人受损的听力传导机构得到重建，从而改善听力。
　　耳膜穿孔可以用肌肉膜（颞肌筋膜）或软骨膜修复。听骨破坏可以用假体听骨（TORP或PORP）、软骨等修复并重建听力。
　　手术时通常在耳膜内侧放置一片软骨以避免术后疤痕并改善中耳功能，增加耳膜活动性。如果中耳内充满疤痕组织或听小骨完全破坏，这时为了改善听力，可以采取二期手术的方法。第一次手术目的在于清除病变组织并减少疤痕，第二次手术的目的在于重建听力。是否选择二期手术要根据第一次手术情况来决定。