慢性乙肝的根本治疗措施是抗病毒，所用药物主要有α-干扰素和核苷类似物两大类。在评价抗病毒疗效时，需要进行乙肝病毒学检测，检测内容包括乙肝五项指标（俗称两对半）和病毒脱氧核糖核酸（即：HBV DNA）。

　　乙肝五项指标检测结果常常用阴性和阳性来表示，正常情况下应该全部是阴性，接种过乙肝疫苗或感染了乙肝病毒并完全恢复者可以出现表面抗体阳性，而慢性乙肝病毒感染者表现为表面抗原和核心抗体持续阳性，同时可能还有e抗原或e抗体阳性。HBV DNA低于检测水平为阴性，高于检测水平为阳性。

　　“乙肝转阴”是临床医生、患者及其亲属普遍关注的问题，但“乙肝转阴”是一个笼统的说法，不同的检测项目有不同的概念，其临床意义也不完全一样。

　　1、表面抗原转阴
　　表面抗原是乙肝病毒感染的重要指标，也是健康查体的必查项目。它的转阴是乙肝患者治疗的终极目标，也就是说彻底清除了病毒感染。
　　表面抗原转阴一般都伴随着HBV DNA 和e抗原的转阴，肝炎从此完全康复。但也有例外情况，这就是所谓的“隐匿型肝炎”，即：表面抗原阴性，但血液或肝组织内HBV DNA仍阳性，并经常出现转氨酶升高。最近几年，隐匿型肝炎已引起了许多学者的关注。
　　2、e抗原转阴
　　临床上我们可以把慢性乙肝分为两大类，一类是e抗原阳性慢性乙肝，另一类是e抗原阴性慢性乙肝。e抗原是病毒复制活跃、传染性强的指标。对第一类患者来说，当e抗原由阳转阴、同时又伴有e抗体由阴转阳时，便是俗称的“大三阳”变成了“小三阳”。
　　出现这种情况时提示病情趋于稳定，病毒复制能力减弱，传染性明显降低。把“大三阳”变为“小三阳”是e抗原阳性患者抗病毒治疗的主要目标之一，用α-干扰素治疗这一概率在30％~40％，用核苷类药物治疗这一概率在20％~30％。
　　3、HBV DNA转阴
　　检测HBV DNA可以直接了解体内病毒的含量，HBV DNA越高说明病毒复制越活跃。但应注意的是，由于检测技术的限制，各实验室都设定有最低检测值，也就是说当HBV DNA低于这一水平就检测不到了。所以，当HBV DNA低于检测水平或者报告阴性时并不等于体内彻底没有了病毒，只是说明病毒含量很低、低到现有的技术水平检测不到而已。
　　还应注意的是，现在各个医院检测HBV DNA采用的都是聚合酶链法（PCR），这一检测技术要求非常高，不同的实验条件，检查结果会有一定差别，所以一定不要把不同医院的检查结果进行相互比较。
　　另外，在日常工作中我们经常会碰到患者或亲属拿着HBV DNA的检查结果询问病情严重不严重，其实， HBV DNA反映的只是患者体内病毒的复制状态和传染性高低，而病情的轻重与否主要看肝功。HBV DNA水平再高，但只要肝功正常，就可以认为病情不严重，甚至只是一种病毒携带状态；但如果转氨酶很高，并且有黄疸，那么即使HBV DNA阴性，病情也是严重的。
　　4、不要盲目追求转阴
　　我们说，表面抗原转阴是慢性乙肝患者治疗的终极目标，但是，由于乙肝病毒的顽固性以及药物治疗的局限性，所以能够达到这一目标的患者微乎其微，虽然，近十多年来随着抗病毒治疗的广泛开展，表面抗原转阴的现象逐渐增多，但在我国庞大的乙肝群体中仍然是占极少数。另外，抗病毒治疗是有一定指证的，这就是：转氨酶持续或反复升高、HBV DNA阳性。
　　我们不主张乙肝病毒携带者进行抗病毒治疗，因为此时治疗效果不会很好；我们更不主张为了能够抗病毒治疗，而采取饮酒或疲劳作业等不良方式有意让转氨酶升高。
　　我们应该明白，不管采用何种抗病毒药，我们最基本的治疗目标就是保护肝细胞、让肝功稳定正常；肝功本来就正常，而要进行人为破坏，这是本末倒置的错误行为。总之，盲目追求乙肝转阴是不可取的，在治疗上我们要保持科学和理智，特别是不要轻信虚假医药广告不切实际的宣传，以免给自己背上沉重的思想负担和经济负担。