常因病变部位不同而出现不同的临床症状，主要表现为周期性发作。无症状者约为20％左右。

　　痛 经 是内膜异位症的典型症状，以继发性，渐进性痛经为特点。大多发生在经前、经期，多为经前1～2天，经期第1天最明显，月经净后疼痛缓解以致消失。疼痛多位于下腹部和腰骶部，可放射至阴道、会阴、肛门。部分患者有性交痛和肛门坠胀感，经期尤甚。

　　月经失调 经量增多，经期延长或月经紊乱。若卵巢内膜异位囊肿破裂则可出现急腹痛，多发生于月经期，可伴恶心呕吐和肛门坠胀感。

　　不孕内膜异位患者不孕率达60％以上。

　　肠道或泌尿道症状 异位病灶累及直肠、乙状结肠、膀胱、输尿管时，可出现排便困难、腹泻、便秘、甚至周期性便血、尿频、尿急、血尿等症状。