饮食中回避牛奶和牛奶制品，避免牛奶暴露。为满足CMPA患儿的营养需要，是否选择替代配方主要取决于患儿的喂养方式、年龄及对其他食物的过敏性。
　　替代配方选择：①氨基酸配方：由100％游离氨基酸组成，对95％以上的CMPA患儿有效，无免疫源性，推荐为一线的诊断和治疗配方。②深度水解配方：以乳清蛋白或酪蛋白为氮源，分子量<3000 Da的肽，对90％以上的CMPA患儿有效，无免疫源性，推荐为治疗配方。③部分水解配方：分子量3000~10000 Da的短肽，降低了抗原表位数量，同时保持了牛奶蛋白的免疫源性，刺激机体产生免疫耐受。仅对50-66％的CMPA患儿有效，因此，部分水解配方仅推荐为预防配方，诱导免疫耐受，不用于治疗。④其他：有报道以大米为基质的深度水解配方用于治疗CMPA安全有效，对于素食家庭或不能耐受氨基酸配方或以牛奶蛋白为基质的深度水解配方的婴儿，可以选择大米蛋白深度水解配方。婴儿大豆配方，因植酸盐和大豆异黄酮的影响，对于＜6月婴儿，可作为二线的候选配方。其他哺乳动物的奶（如绵羊奶，山羊奶，骆驼奶），它们的组成与人乳差别很大，大部分营养不足或存在交叉过敏性（如羊奶），不推荐用于CMPA。
　　纯母乳喂养：尽可能纯母乳喂养至少6个月。母亲饮食回避牛奶及所有奶制品2-4周，同时补充钙剂及维生素D，避免营养缺乏。出现以下情况时，建议转为氨基酸配方喂养：母亲饮食回避后，患儿症状持续且严重；患儿出现生长发育迟缓；母亲饮食回避导致严重体重减轻影响母亲健康；母亲无法饮食回避或出现心理问题。
　　人工喂养：选择氨基酸配方粉2-4周。如症状无缓解，排除牛奶蛋白过敏。如症状缓解或消失，进行牛奶蛋白激发试验，阴性患儿排除牛奶蛋白过敏；阳性患儿进行长期饮食管理。
　　混合喂养（母乳+牛奶配方粉）：继续母乳喂养，母亲回避牛奶及所有奶制品；婴儿配方粉首选氨基酸配方，2-4周。如症状无缓解，排除牛奶蛋白过敏。如症状缓解或消失，进行牛奶蛋白激发试验，阴性患儿排除牛奶蛋白过敏；阳性患儿进行长期饮食管理。
　　饮食回避时间：确诊CMPA的婴儿，应回避牛奶蛋白，使用治疗配方至少3-6个月，或直到9-12月龄。有严重的速发反应或重症CMPA患儿，饮食回避时间为12个月。
　　辅食添加：研究发现在4月龄前引入固体食物可能导致过敏性疾病的发生，而在这之后引入固体食物可促进免疫耐受形成。美国儿科学会、欧洲过敏与临床免疫学会及欧洲儿科胃肠病肝病营养协会的指南建议4-6月添加辅食。首先选择蔬菜和水果等低致敏性食物，可在家中进行。每次引入一种，持续1周，从少量开始，逐渐增加食入量。首次引入新的食物选择上午时间，以便监测进食后的反应。引入蛋白类食物时，煮熟以降低致敏性。在医生指导下引入高风险致敏食物：鱼、小麦、坚果、奶油、鸡蛋。